A Irmandade de São Nicolau foi instituída pelos Estudantes de Guimarães no século XVII. Os seus primeiros estatutos datam de 6 dezembro de 1691, dia de São Nicolau. Todavia há registos muito anteriores de culto e devoçao ao Santo Padroeiro dos Estudantes, como por exemplo a vontade de construir uma capela em sua honra, cuja pedra fundamental data de 1662.
